Il Decreto Ministeriale 23 dicembre 2014, relativo alla Organizzazione e funzionamento dei Musei statali, istituisce - per Istituti dotati di autonomia - i seguenti Organi istituzionali:

1. Direttore
2. Consiglio di Amministrazione
3. Comitato Scientifico
4. Collegio dei revisori dei Conti

Agli Organi Istituzionali spetta il compito di: a) garantire lo svolgimento della missione del Museo; b) verificare l'economicità, l'efficienza e l'efficacia dell'attività del Museo; c) verificare la qualità scientifica dell'offerta culturale e delle pratiche di conservazione, fruizione e valorizzazione e comunicazione dei beni in consegna al Museo. 

Direttore

Dott. Alessandro D'Alessio

Consiglio di Amministrazione

Il Consiglio di amministrazione è composto dal direttore, che lo presiede, e da quattro membri designati dal Ministro dei beni e delle attività culturali e del turismo, di cui uno d’intesa con il Ministro dell’istruzione, dell’università e della ricerca e uno d’intesa con il Ministro dell’economia e delle finanze, scelti tra esperti di chiara fama nel settore del patrimonio culturale.

La composizione è la seguente:

Dott. Alessandro D'Alessio (Presidente)

dr. Flavio De Benedictis;

dr. Alessandro Leon;

dr.ssa Ludovica Purini;

dr.ssa Alfonsina Russo.

Comitato Scientifico

Il Comitato scientifico è composto dal direttore e da membri individuati tra professori universitari di chiara fama, in settori attinenti o affini all'ambito disciplinare di attività del Museo o esperti di particolare e comprovata qualificazione scientifica e professionale in materia di tutela e valorizzazione dei beni culturali.

La composizione è la seguente:

Dott. Alessandro D'Alessio (Presidente);

Prof. Simon Keay;

Prof. Carlo Pavolini;

Dott.sa Rita Turchetti;

Porf. Fausto Zevi. 

Collegio dei Revisori dei Conti

Con Decreto Ministro per i Beni e le attività Culturali e il Turismo del 15.04.2020 n° 173 è stato nominato il Collegio dei Revisori dei Conti del Parco Archeologico di Ostia antica.

Il Collegio dei revisori dei conti è composto da tre componenti effettivi, di cui un funzionario del Ministero dell’economia e delle finanze con funzioni di presidente. I componenti sono scelti tra soggetti iscritti al Registro dei revisori contabili e nominati con decreto del Ministro dei beni e delle attività culturali e del turismo. Il Collegio svolge attività di controllo di regolarità amministrativo-contabile.

La composizione è la seguente:

Dott.ssa Antonella Coni (Presidente);

Dott. Paolo Agnesi;

Dott. Maurizio Santoro.

Tabella dei Revisori

Nome	Curriculum Vitae	Provvedimento Incarico	Ruolo	Durata incarico	Dichiarazione per l'assunzione dell'incarico sull'insussistenza di cause di inconferibilità e/incompatibilità
Dott.ssa Antonella Coni	curriculum Coni	D.M. 173 del 15/04/2020	Presidente	3 Anni	Resa il 23 aprile 2020
Dott. Paolo Agnesi	Curriculum Agnesi	D.M. 1173 del 15/04/2020	Componente Effettivo	3 Anni	Resa il 23 aprile 2020
Dott. Maurizio Santoro	Curriculum Santoro	D.M. 173 del 15/04/2020	Componente Effettivo	3 Anni	Resa il 23 aprile 2020